La naturopathie met l'accent sur la prévention des maladies par une nutrition adéquate, une activité physique régulière, une gestion des émotions…

Son objectif majeur est la prévention en éduquant son client à un mode de vie sain favorisant une bonne santé.

La maladie n’est pas une fatalité : « On ne tombe pas malade, on le devient » Alain Rousseaux. La maladie est souvent la résultante de l’accumulation d’erreurs dans son hygiène de vie. 

80 % des maladies cardiovasculaires et 40 % des cancers sont évitables en agissant sur les facteurs de risque tels que le tabagisme.

La naturopathie est considérée comme holistique en ce qu’elle prend en compte l'individu dans sa globalité (l’être humain n’est pas simplement une somme d’organes ou de systèmes mais une globalité physique, énergétique, émotionnelle, psychique et sociale), plutôt que de se focaliser uniquement sur des symptômes ou des maladies spécifiques.

Son objectif est de comprendre le fonctionnement global et interdépendant de l’organisme et les véritables causes des déséquilibres physiologiques en prenant en compte des facteurs tels que l'alimentation, le mode de vie, la gestion des émotions… afin de rééquilibrer le terrain de son client et rétablir son capital santé.

Par exemple, la naturopathie considère que le bien-être physique est intimement lié à la santé psychologique et émotionnelle, un déséquilibre dans l'un pouvant affecter l'autre. Cette approche vise à promouvoir un bien-être durable en intégrant toutes les dimensions de la vie de l'individu.

La santé intégrative est une approche de la santé qui combine les médecines conventionnelles (comme la médecine allopathique pratiquée par les médecins généralistes ou spécialistes) avec des méthodes complémentaires comme la naturopathie.

La santé intégrative vise à soigner la personne dans sa globalité – corps, esprit, émotions – en utilisant le meilleur des deux mondes : les traitements médicaux classiques et les approches complémentaires naturelles, selon les besoins du patient.

Il n’y a pas de protocole en naturopathie car chaque individu est unique et chaque organisme fonctionne selon ses propres lois.

Le naturopathe adapte donc ses recommandations dans le cadre d’un programme personnalisé à chaque individu tenant compte de ses besoins spécifiques, de son histoire, de son environnement, de ses contraintes, de ses conditions de vie et de son état de santé général.